南京农业大学的研究生教育具有悠久的历史，为我国的农业教育、科技、管理和生产做出了重要贡献。学校前身私立金陵大学农学院和国立中央大学农学院于1936-1945年共招收和培养了65名研究生，占当时全国农科的50%。新中国成立后，南京农学院于1949-1966年，累计招收和培养了64名研究生。两期培养的研究生成为我国农科重要的学科带头人和骨干。