浙江大学医学院的前身是由1912年创办的浙江医学专门学校和1945年创设的国立浙江大学医学院合并（1952年）而成的浙江医学院，1960年4月升格为浙江医科大学。1998年，与浙江大学、杭州大学、浙江农业大学合并成立新的浙江大学，并于次年重组成立了浙江大学医学院和药学院。